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中南大学团队研发孤独症谱系疾病诊断新技术

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中南大学团队研发孤独症谱系疾病诊断新技术

日前,论文《脆性X综合征的综合分析:长读长测序全面解析FMR1基因变异”》在国际顶级学术期刊“Clinical Chemistry”《临床化学》在线发表。

此项研究成果是中南大学生命科学学院医学遗传学研究中心的邬玲仟、梁德生教授课题组攻克。脆性X综合征(FXS)是智力障碍和孤独症谱系障碍中最常见的单基因病,男性发病率为1/4000,女性发病率为1/6000-1/8000。95%的FXS患者由FMR1基因5’端非翻译区的(CGG)n三核苷酸重复序列扩增引起。女性前突变(55-200次CGG重复)携带者的CGG区不稳定,在向后代传递过程中有很大几率(约80%,CGG重复数越高几率越大)扩展为全突变,以致生育FXS患者。

由于女性前突变携带率高达1/200-1/600,对育龄或早孕期女性进行携带者筛查是最好的防控手段。而前突变携带者罹患脆性X相关疾病的风险也会增加:男性主要有震颤/共济失调综合征,女性主要有原发性卵巢功能不全和神经精神障碍等。因此,精准的基因筛查和诊断对于FXS的防控至关重要。

FXS的基因变异十分复杂且类型繁多,迄今缺少全面、精准且高效的基因检测手段。由于(CGG)n超高GC含量的影响,一代和二代测序均无法有效检测,目前临床常规采用三重复引物 PCR 法和DNA印迹杂交法,但检测(CGG)n长度受限,且无法判断AGG打断的位置和数量,而AGG打断对患者预后判断和后代风险预测十分重要。

中南大学课题组开发了一种长片段PCR(LR-PCR)与三代测序结合的FXS综合分析(CAFXS)新方法,一次性检测(CGG)n扩增、AGG打断、基因内SNVs、Indels、微缺失和大片段缺失等全部变异类型,同时检出低至0.5%的前突变及全突变低比例嵌合体,真正实现FXS的全面、精准、高效的基因筛查和诊断,检测成本也已接近常规方法,临床回顾性试验证明灵敏度和特异性达到99.9%,具有广阔的临床应用前景。

据悉,邬玲仟、梁德生团队在遗传病的基因诊断和产前诊断新技术临床应用研究领域处于国际前沿。

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